Visiomics

Visiomics2019-11-21T14:17:53+01:00

Projekt Beschreibung

Anwendung Details

Unsere Kompetenz:

Data Analytics

Studio:
Data Science

Auftraggeber:

Plattform zur Unterstützung einer integrierten Analyse von Bild- und multiOMIC-Daten auf Basis von Flüssigbiopsien für die Tumordiagnostik.

1.11.2017 – 31.10.2019

VISIOMICS hat sich zum Ziel gesetzt, eine umfassende Lösung für die verfeinerte Tumordiagnostik zu entwickeln, die Workflow-Management, mehrstufige Datenintegration und erweiterte Benutzeroberflächenlösungen in einem effizienten und zertifizierbaren Workflow vereint.

Das Neuroblastom als seltene Krankheit soll als Modell zur Lösung der derzeit häufig beobachteten Probleme in der Diagnostik bei personalisierten Behandlungsstrategien dienen, d.h. zur Integration von mehrstufigen Daten trotz Knappheit von Proben und unvollständigen Datensätzen.

Wir planen daher, unsere Analyse zu erweitern, indem wir DNA/RNA-Sequenzierungs- und SNP-Arraydaten integrieren und mit bildgebenden morphologischen und Antikörperfärbungseigenschaften von disseminierten Tumorzellen kombinieren, die aus flüssigen Biopsien isoliert wurden.
Die Integration erfolgt sequentiell, um Gene und/oder Zellmerkmale besser zu definieren, so dass bereits zum Zeitpunkt der Diagnose zwischen Proben von Rückfall- und Nicht-Rückfallpatienten unterschieden werden kann.
Die Softwareplattform VISIOMICS, die mit einer zentralen Datenbank zur Speicherung von Roh- und Verarbeitungsdaten verknüpft ist, wird ein wichtiges Werkzeug sein, das eine effiziente Benutzerinteraktion und Datenvisualisierung ermöglicht, um Expertenwissen in klinische/diagnostische Analyse-Workflows zu übersetzen.

Unser Forschungsteam

Mihai Lupu, PhD
Mihai Lupu, PhD
Studioleiter
Dr. Abdel Aziz Taha
Dr. Abdel Aziz Taha
Senior Researcher
Alexandros Bampoulidis, BSc
Alexandros Bampoulidis, BSc
Researcher

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